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ALTAMIRA

Se recomienda la lectura la ?guía de usuario del Supercomputador Altamira antes de la realización de la práctica.

Práctica 1

El objetivo de esta práctica es tomar contacto con el uso del Supercomputador Altamira, así como del sistema de colas ?SLURM instalado en él:

  1. Conéctese al frontend de Altamira (altamira1.ifca.es) mediante el comando ssh (Linux/Mac OS) o el programa ?PyTTY(Windows). Para ello, previamente cada alumno ha recibido un correo con una cuenta y una clave de acceso:
    [user@localmachine ~]$ ssh user@altamira1.ifca.es
    
  1. Desde el frontend, utilizando la plantilla que se adjunta enviar un job. Para lo cual, será necesario utilizar el comando mnsubmit, así como los editores vi o nano.

Plantilla:

#!/bin/bash
#@ job_name = sleep_%j
#@ initialdir = .
#@ output = sleep_%j.out
#@ error = sleep_%j.err
#@ total_tasks = 1
#@ wall_clock_limit = 00:02:00
 
echo "Nodo: ${SLURM_NODELIST}"

echo "Hora de inicio `date`"
sleep 30
echo "Hora de fin `date`"

Práctica 2

Una vez enviado nuestro primer job,

?HelloWorldOpenMP

[user@login1 ~]$ module load gcc
load gcc/4.6.3 (PATH, MANPATH, LD_LIBRARY_PATH)

[user@login1 ~]$ gcc HelloWorldOpenMP.c -fopenmp -o HelloWorldOpenMP
#!/bin/bash 
#@ job_name = openmp_%j
#@ initialdir = .
#@ output = openmp_%j.out
#@ error = openmp_%j.err
#@ total_tasks = 32
#@ wall_clock_limit = 00:02:00
 
echo "Numero de procesos: ${SLURM_NPROCS}"
echo "Numero de nodos: ${SLURM_NNODES}"
echo "Nodos: ${SLURM_NODELIST}"

./HelloWorldOpenMP
$ module load gcc
$ mnsubmit HelloWorldOpenMP_template