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ALTAMIRA
Se recomienda la lectura la guía de usuario del Supercomputador Altamira antes de la realización de la práctica.
Práctica 1
El objetivo de esta práctica es tomar contacto con el uso del Supercomputador Altamira, así como del sistema de colas SLURM instalado en él:
- Conéctese al frontend de Altamira (altamira1.ifca.es) mediante el comando ssh (Linux/Mac OS) o el programa PyTTY(Windows). Para ello, previamente cada alumno ha recibido un correo con una cuenta y una clave de acceso:
[user@localmachine ~]$ ssh user@altamira1.ifca.es
- Desde el frontend, utilizando la plantilla que se adjunta enviar un job. Para lo cual, será necesario utilizar el comando mnsubmit, así como los editores vi o nano.
Plantilla:
#!/bin/bash #@ job_name = sleep_%j #@ initialdir = . #@ output = sleep_%j.out #@ error = sleep_%j.err #@ total_tasks = 1 #@ wall_clock_limit = 00:02:00 echo "Nodo: ${SLURM_NODELIST}" echo "Hora de inicio `date`" sleep 30 echo "Hora de fin `date`"
- Envío de jobs:
[user@login1 ~]$ mnsubmit sleep_template
- Para monitorizar el job use el comando mnq:
[user@login1 ~]$ mnq JOBID NAME USER STATE TIME TIMELIMIT CPUS NODES NODELIST(REASON) 621336 0.sleep_ user PENDING 0:00 2:00 1 1 (Priority)
- Comprobar el resultado obtenido en los ficheros de output y error.
$ module load gcc
$ gcc HelloWorldOpenMP.c -o HelloWorldOpenMP
#!/bin/bash #@ job_name = openmp_%j #@ initialdir = . #@ output = openmp_%j.out #@ error = openmp_%j.err #@ total_tasks = 32 #@ wall_clock_limit = 00:02:00 echo "Numero de procesos: ${SLURM_NPROCS}" echo "Numero de nodos: ${SLURM_NNODES}" echo "Nodos: ${SLURM_NODELIST}" ./HelloWorldOpenMP
$ module load gcc $ mnsubmit HelloWorldOpenMP_template