Changes between Version 40 and Version 41 of ColasPBS

Timestamp:

Jan 5, 2011 11:55:08 AM (11 years ago)

Author:

lluis

Comment:

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ColasPBS

@@ -141 +141 @@
 ### Array request
 #PBS -t [array]
+### System variable
+#PBS -v [variable]
 ### Number of nodes and processors per node
 #PBS -l nodes=[N]:ppn=[M]
@@ -166 +168 @@
    * 1-100: 100 jobs del 1 al 100
    * 1-5,15,35: 5 jobs del 1 al 5, el 15 y el 35
+ * ''-v [variable]: ''para mandar un job que tome el valor {{{[variable]}}}
  * ''-l nodes=[N]:ppn:[M] :'' número de nodos ({{{[N]}}}) y número de cpus a coger de cada nodo ({{{[M]}}}) la aplicación se repartirá en [N]x[M] cpus
 
@@ -182 +185 @@
   {{{
 qsub -N [jobname] -l walltime=[HH]:[MM]:[SS] -q [queueNAME] -m [flags] -M [emailCOUNT] -e [rutaArchivo] 
--o [rutaArchivo] -W afterany:[jobid] -t [array] -l nodes=[N]:ppn=[M] [aplicacion]
+-o [rutaArchivo] -W afterany:[jobid] -t [array] -v [variable] -l nodes=[N]:ppn=[M] [aplicacion]
 }}}
 
@@ -456 +459 @@
 }}}
 
+=== Trabajo con variable ===
+Tomamos el job sencillo de ejemplo. En este caso el tiempo de espera para la escript se lo pasaremos como variable del job. 
+{{{
+#!/bin/bash
+### Job name
+#PBS -N prueba
+### Max run time
+#PBS -l walltime=00:00:10
+### Queue name 
+#PBS -q grid 
+### Number of nodes and processors per node
+#PBS -l nodes=1:ppn=1
+
+cd ${PBS_O_WORKDIR}
+
+./espera.bash ${waitTIME}
+}}}
+
+Lanzando el job:
+  {{{
+[lluis@mar CursilloPBS]$ qsub -v waitTIME='60' prueba.pbs 
+}}}
+
 == Monitorización del clúster ==
 Por entorno web está instalado el [http://www.meteo.unican.es/ganglia/ ganglia]. En este entorno se muestra toda la actividad de los nodos (consumo de cpu, memoria, disocs duros, etc...) con una interfaz gráfica.